Forskningscenteret COM blev grundlagt i 1998 som en fusion mellem de forskningsgrupper, der arbejdede med fotonik på Mikroelektronikcenteret (MIC) og afdelingen for Bredbåndstelekommunikation ved Instituttet for Elektromagnetiske Systemer, begge DTU. Initiativet udsprang i Forskningsministeriet og Undervisningsministeriet i samarbejde med Danmarks Tekniske Universitet. Målet var at etablere COM som en forskningsorganisation indenfor optisk kommunikation i verdensklasse samt at sikre et samarbejde med dansk industri.
I 2001 fødtes et nyt og større COM som følge af en fusion mellem tre enheder: Center for teleinformation CTI, Instituttet for Telekommunikation og forskningscenter COM, alle på DTU. Fusionen blev drevet af en ambition om at kombinere og integrere de individuelt udviklede ekspertiser og samle indsatserne på DTU indenfor optisk kommunikation og telekommunikation i én styrket enhed.
Med alle telekommunikations-aktiviteter samlet på et sted, besluttede DTU i 2001 at introducere en ny M.Sc. retning indenfor telekommunikation. Dermed blev COM også konsolideret som uddannelsescenter.
COM ændrede organisatorisk status fra at være et center til pr. september 2005 at være COM•DTU, Institut for kommunikation, optik & materialer.
I 2008 er COM•DTU blevet fusioneret med nogle forskningsgrupper på Risø og har skiftet navn til DTU Fotonik, Institut for Fotonik.
Hvert år er der nu mere end 80 studerende, der får deres M.Sc. grad hos DTU Fotonik, og gennem årene er flere nye uddannelsesinitiativer blevet startet. DTU Fotonik regner disse initiativer for at være meget vigtige skridt i bestræbelserne på at uddanne topkvalificerede kandidater til bl.a. den danske telekommunikationsindustri og elektronik og optik industri.